Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IFT27Q9BW83 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms