Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIRIP3Q9BW71 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRIP3Q9BW71 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms