Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PAGR1Q9BTK6 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms