Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RHOXF2Q9BQY4 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RHOXF2Q9BQY4 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms