Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 AC087741.1-204ENST00000573935 646 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IFT140Q96RY7 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms