Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HIC2Q96JB3 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms