Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SDCCAG3Q96C92 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3Q96C92 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3Q96C92 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3Q96C92 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3Q96C92 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3Q96C92 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3Q96C92 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3Q96C92 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3Q96C92 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3Q96C92 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3Q96C92 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3Q96C92 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3Q96C92 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3Q96C92 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3Q96C92 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3Q96C92 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3Q96C92 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3Q96C92 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3Q96C92 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3Q96C92 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3Q96C92 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3Q96C92 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3Q96C92 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3Q96C92 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3Q96C92 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3Q96C92 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3Q96C92 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3Q96C92 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3Q96C92 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3Q96C92 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SDCCAG3Q96C92 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.3 ms