Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C17orf47Q8NEP4 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
C17orf47Q8NEP4 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
C17orf47Q8NEP4 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C17orf47Q8NEP4 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C17orf47Q8NEP4 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C17orf47Q8NEP4 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C17orf47Q8NEP4 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C17orf47Q8NEP4 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C17orf47Q8NEP4 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C17orf47Q8NEP4 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C17orf47Q8NEP4 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C17orf47Q8NEP4 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C17orf47Q8NEP4 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C17orf47Q8NEP4 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C17orf47Q8NEP4 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C17orf47Q8NEP4 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C17orf47Q8NEP4 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
C17orf47Q8NEP4 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
C17orf47Q8NEP4 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C17orf47Q8NEP4 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
C17orf47Q8NEP4 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
C17orf47Q8NEP4 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C17orf47Q8NEP4 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
C17orf47Q8NEP4 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C17orf47Q8NEP4 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C17orf47Q8NEP4 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C17orf47Q8NEP4 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C17orf47Q8NEP4 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
C17orf47Q8NEP4 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C17orf47Q8NEP4 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
C17orf47Q8NEP4 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C17orf47Q8NEP4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C17orf47Q8NEP4 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C17orf47Q8NEP4 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms