Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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TRAPPC6BQ86SZ2 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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TRAPPC6BQ86SZ2 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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TRAPPC6BQ86SZ2 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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TRAPPC6BQ86SZ2 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAPPC6BQ86SZ2 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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TRAPPC6BQ86SZ2 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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TRAPPC6BQ86SZ2 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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TRAPPC6BQ86SZ2 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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