Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms