Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LPCAT2Q7L5N7 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms