Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCBE1Q6UXH8 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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