Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms