Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP28Q4G0W2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms