Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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