Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM187BQ17R55 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms