Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPRNQ16849 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms