Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DUSP6Q16828 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DUSP6Q16828 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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