Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 RBPMSLP-201ENST00000433427 502 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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