Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
ZNF239Q16600 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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ZNF239Q16600 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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