Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLC18A3Q16572 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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