Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SSPNQ14714 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms