Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEMA3AQ14563 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SEMA3AQ14563 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA3AQ14563 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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