Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CKAP5Q14008 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms