Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NCOA4Q13772 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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