Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRF5Q13568 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IRF5Q13568 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms