Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMAD4Q13485 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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