Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM2Q13029 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM2Q13029 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
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