Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GRIK2Q13002 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK2Q13002 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK2Q13002 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK2Q13002 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK2Q13002 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK2Q13002 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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GRIK2Q13002 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK2Q13002 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK2Q13002 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK2Q13002 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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GRIK2Q13002 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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GRIK2Q13002 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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GRIK2Q13002 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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GRIK2Q13002 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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GRIK2Q13002 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK2Q13002 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK2Q13002 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK2Q13002 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GRIK2Q13002 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK2Q13002 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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GRIK2Q13002 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK2Q13002 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK2Q13002 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK2Q13002 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GRIK2Q13002 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GRIK2Q13002 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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