Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NFX1Q12986 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms