Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
FOXF2Q12947 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FOXF2Q12947 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms