Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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FOXF1Q12946 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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FOXF1Q12946 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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FOXF1Q12946 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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