Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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LMAN2Q12907 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LMAN2Q12907 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.6 ms