Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN1Q12860 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN1Q12860 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN1Q12860 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN1Q12860 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN1Q12860 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN1Q12860 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN1Q12860 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN1Q12860 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN1Q12860 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN1Q12860 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN1Q12860 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN1Q12860 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN1Q12860 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN1Q12860 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNTN1Q12860 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN1Q12860 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN1Q12860 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN1Q12860 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN1Q12860 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN1Q12860 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN1Q12860 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN1Q12860 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTN1Q12860 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN1Q12860 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN1Q12860 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN1Q12860 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN1Q12860 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN1Q12860 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN1Q12860 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN1Q12860 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN1Q12860 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN1Q12860 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN1Q12860 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN1Q12860 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN1Q12860 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN1Q12860 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN1Q12860 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN1Q12860 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN1Q12860 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN1Q12860 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN1Q12860 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CNTN1Q12860 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN1Q12860 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN1Q12860 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN1Q12860 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN1Q12860 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN1Q12860 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN1Q12860 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN1Q12860 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN1Q12860 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN1Q12860 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CNTN1Q12860 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN1Q12860 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN1Q12860 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CNTN1Q12860 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN1Q12860 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN1Q12860 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN1Q12860 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN1Q12860 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTN1Q12860 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CNTN1Q12860 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CNTN1Q12860 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CNTN1Q12860 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CNTN1Q12860 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CNTN1Q12860 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CNTN1Q12860 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CNTN1Q12860 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CNTN1Q12860 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CNTN1Q12860 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CNTN1Q12860 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CNTN1Q12860 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CNTN1Q12860 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CNTN1Q12860 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CNTN1Q12860 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CNTN1Q12860 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CNTN1Q12860 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CNTN1Q12860 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN1Q12860 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN1Q12860 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN1Q12860 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CNTN1Q12860 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN1Q12860 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN1Q12860 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN1Q12860 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN1Q12860 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN1Q12860 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN1Q12860 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN1Q12860 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN1Q12860 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN1Q12860 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN1Q12860 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN1Q12860 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN1Q12860 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN1Q12860 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN1Q12860 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN1Q12860 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN1Q12860 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN1Q12860 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CNTN1Q12860 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms