Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FMODQ06828 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FMODQ06828 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FMODQ06828 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
FMODQ06828 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FMODQ06828 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FMODQ06828 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
FMODQ06828 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
FMODQ06828 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms