Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
E2F1Q01094 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms