Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDC42EP1Q00587 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms