Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDK16Q00536 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms