Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
HOXC5Q00444 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms