Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PITX1P78337 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PITX1P78337 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PITX1P78337 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms