Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ERVFC1P60507 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms