Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATXN3P54252 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms