Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCT8P50990 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCT8P50990 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCT8P50990 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCT8P50990 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCT8P50990 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCT8P50990 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms