Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC11A1P49279 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms