Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ITGAEP38570 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms