Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGCXP38435 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGCXP38435 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGCXP38435 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGCXP38435 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGCXP38435 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGCXP38435 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGCXP38435 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGCXP38435 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGCXP38435 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGCXP38435 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGCXP38435 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGCXP38435 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GGCXP38435 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GGCXP38435 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGCXP38435 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GGCXP38435 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGCXP38435 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGCXP38435 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGCXP38435 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGCXP38435 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGCXP38435 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGCXP38435 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GGCXP38435 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGCXP38435 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GGCXP38435 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GGCXP38435 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GGCXP38435 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GGCXP38435 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms