Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HOXD12P35452 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD12P35452 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD12P35452 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD12P35452 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD12P35452 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD12P35452 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD12P35452 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD12P35452 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD12P35452 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD12P35452 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD12P35452 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD12P35452 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD12P35452 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD12P35452 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD12P35452 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD12P35452 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD12P35452 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD12P35452 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD12P35452 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD12P35452 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD12P35452 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD12P35452 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD12P35452 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD12P35452 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD12P35452 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD12P35452 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD12P35452 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD12P35452 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD12P35452 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD12P35452 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD12P35452 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HOXD12P35452 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HOXD12P35452 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD12P35452 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HOXD12P35452 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HOXD12P35452 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD12P35452 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD12P35452 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HOXD12P35452 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXD12P35452 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms