Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms