Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

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Length 766 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BRAFP15056 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BRAFP15056 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BRAFP15056 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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