Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RARGP13631 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RARGP13631 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RARGP13631 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RARGP13631 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RARGP13631 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RARGP13631 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RARGP13631 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RARGP13631 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RARGP13631 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RARGP13631 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RARGP13631 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RARGP13631 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RARGP13631 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RARGP13631 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RARGP13631 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RARGP13631 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RARGP13631 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RARGP13631 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RARGP13631 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RARGP13631 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RARGP13631 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RARGP13631 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RARGP13631 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RARGP13631 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RARGP13631 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RARGP13631 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RARGP13631 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RARGP13631 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RARGP13631 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RARGP13631 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RARGP13631 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RARGP13631 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RARGP13631 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RARGP13631 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RARGP13631 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARGP13631 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARGP13631 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARGP13631 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARGP13631 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARGP13631 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARGP13631 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARGP13631 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RARGP13631 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARGP13631 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARGP13631 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARGP13631 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RARGP13631 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms